se strofinando il dito sulla patina marrone si polverizza, significa che sono diatomee, ossia alghe dovute ad alte concentrazioni di silicio nel tuo acquario e non al tuo filtro che non funziona bene, cmq se sono parecchi mesi che non lo pulisci magari è ora di farlo...
se vuoi un mio parere personale io preferisco i filtri esterni....hai più spazio e acqua nella vasca ed è più comodo da pulire...
di quanti litri fai i cambi parziali di acqua?