Non credo si riferisca alla melma nel filtro. Ma a quella sul fondale (anche se io dalle foto che hai postato trovo difficoltà a vedere qualcosa).
Se è davvero sporco come dici allora va pulito. Ma qualche foto con qualità maggiore? A me sembrava avessi uno strato di sabbia scura più che sporcizia.
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I cannolicchi non li toccare. Altrimenti distruggi tutto. Sciacqua le spugne se riesci direttamente con un po di acqua dei cambi