Ciao,dopo aver levato sabbia e conchiglie il filtro potresti staccarlo facendo passare del filo da pesca (forse anche quello interdentale potrebbe andare bene) tra il filtro e il vetro, anche perchè stando così al centro ti porta via davvero tanto spazio.
Per il calcare, se non vuoi usare nulla di chimico, vai con aceto e succo di limone: inzuppa un po' di carta assorbente nell'aceto misto a succo di limone e fermala con del nastro carta sul calcare, aspetta un po' poi passa con uno spazzolino da denti o con la parte abrasiva della spugna (quella che solitamente è verde), io ho fatto così per un piccolo acquario da 30 litri ed è stata una bella soddisfazione vedere sparire le macchie di calcare
Se non vuoi faticare tanto con i rimedi naturali nei negozi di acquari ci dovrebbero essere dei prodotti specifici per rimuovere il calcare.
A prescindere dal metodo che userai alla fine sciacqua bene il tutto, un bel filtro esterno e il gioco è fatto!