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Secondo me...
Avendo lasciato le rocce al buio e avendole comunque movimentate hai causato delle morie, vuoi nella popolazione batterica, vuoi nei microrganismi che c'erano.
Questa materia organica decade e produce inquinanti.
Le alghette con gli inquinanti e la luce dicono "grazie mille" e crescono.
Alla fine tutto il tuo sistema deve ritrovare il suo equilibrio. C'è gente cui riparte il ciclo perchè sposta tre rocce, tu hai rifatto una vasca da quel che capisco, giusto? Penso che dovresti aspettarti tutta la trafila.
Sempre secondo me... io i coralli aspetterei un poco a rimetterli.
In ogni caso senti cosa ti rispondono gli altri CHEE'MMEGLIO :)
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