Non conosco quell'acquario, ma così, a lume di naso, il timer dovrebbe avere due cavi che entrano (la 220V AC della rete) e due cavi che escono e vanno ad alimentare i reattori dei neon. Dovrebbe bastare bypassare il timer e collegare direttamente i cavi entranti con quelli uscenti.
Se i cavi sono in numero maggiore di quelli che ho detto astieniti che vediamo di capire