Spostali pure tranquillamente, più materiale riesci a mettere del vecchio filtro e meglio è!
Se i lavori di sostituzione richiedono un po' di tempo (ma non credo) è preferibile tenere i materiali filtranti fuori dall'acqua (fino a 3 ore i batteri sopravvivono meglio, penso che il tempo sia più che sufficiente)
