ambedue hanno pregi e difetti...
ad esempio l'esterno ti fa risparmiare spazio in vasca (miglior resa estetica) ma aumenta non poco la dispersione del calore che in un acquario di discus non è un fattore da sottovalutare...
io personalmete mi sono convertito al filtro esterno solo recentemente

per quanto riguarda i materiali di filtraggio penso che la parte biologica (cannolicchi,bioballs,spugne) debba essere assolutamente proporzionata (se non addirittura sovradimensionata) al litraggio della vasca...storia a se fa la torba (se la vuoi utilizzare)