sarebbe meglio bollire sempre tutto il bollibile prima di metterlo in acquario, perchè non si sa mai dove sia stato..nel caso delle radici la bollitura serve anche a fargli perdere una buona dose di tannini (che sono la causa della colorazione gialla)..più le fai bollire più tannini elimini..
poi potresti tenere il legno in un secchio per qualche tempo cambiando l'acqua ogni tanto.. man mano l'acqua si colorerà sempre meno, a quel punto lo portai inserire! io ho fatto cosi ed ha funzionato, devi solo essere un po paziente!
ma almeno non limiti la scelta dei legni (che cmq praticamente in ogni caso perdono colore..).. per le rocce, se vorrai avere ph basso, fai solo attenzione che non siano calcaree!