Il filtro con meno probabilità di essere/divenire rumoroso penso sia il filtro interno.
Oltre alla soluzione di mettere garza o cose simili davanti alle bocchette, si potrebbe pensare di mettere dalla parte interna delle bocchette stesse della spugna. Anche così però ci sarà un'alta probabilità di intasamento e tale spugna sarà da pulire frequentemente, in compenso il resto del filtro resterà più pulito

Resto dell'idea che il filtro più adatto per una vasca con avannotti sia quello ad aria, ma, in genere, non è dei più silenziosi.