Il problema con gli acquari chiusi è sia il calore che le lampade ti trasmetterebbero all'acqua, sia la carenza di scambio gassoso sia la scarsa accessibilità alla vasca. Non credo che la posizione della vasca sotto una scala ti influirà e ti darà problemi, se cerchi la vasca di Andrea Dazzi tra le vasche del mese (mi sembra dicembre 2010) è proprio sotto una scala di legno a vista.
Le dimensioni della vasca sono buone e quindi partirei da quelle, anche i due atolli non sono male ma difficili da realizzare su un 100 cm.
Plafo a led ce se sono quante ne vuoi basta guardarsi in giro solo che di solito le plafo a led hanno led diffusi su tutta la lunghezza e non concentrati in due punti, quindi o te la fai fare su misura (ci sono anche delle guide in fai da te se hai voglia e se sai fare) o rinunci alla concentrazione in due punti. Occhio che le plafo a led costano parecchio (io ne ho una nel mio) rispetto ad una più comune a t5, ci sono vantaggi e svantaggi e se vuoi ne parliamo.
Io ti posso dire che con i led mi sto' trovando bene ma gli uso solo da tre mesi quindi è un po' presto per dare giudizi definitivi.
Per il resto prima di darti consigli credo dovresti chiarirti bene che tipo di animali vuoi tenere perchè in base alle loro esigenze si tara l'attrezzatura. Spiego i "coralli" sono comunemente divisi in molli e duri, i duri in LPS e SPS, la richiesta di luce cresce molli =>LPS=>SPS ed anche la qualità dell'acqua cresce nello stesso modo. I duri necessitano di più calcio dei molli e gli sps a rapida crescita più degli LPS. In base a cosa vorrai allevare deciderai di quale atrezzatura hai bisogno. Detto questo guarda in giro (mercatino compreso) che skimmer ti può interessare (tanto quello ti serve di sicuro) e mettiti a studiare ... benvenuto
