Alla fine penso che opterò per il sistema che ti ho descritto, mettendo il manicotto di ingresso acqua in basso e quello di uscita in alto.
Con un tubo di un metro le cose pesanti dovrebbero rimanere in fondo.
Inoltre pensavo di mettere delle vaschette di plastica rettangolari appese al bordo interno della vasca in modo da avere il terriccio bagnato, la crescita e la manutenzione delle piante sotto controllo, e lasciare un corridoio d'acqua per i pesci sotto le vaschette (si sentirebbero anche + protetti): che te ne pare?