Il diffusore potresti metterlo o vicino al filtro come hai detto tu, o nell'angolo in fondo a destra, a patto che al corrente diffonda in vasca le bollicine. Ti consiglio di togliere il beccuccio all'uscita del filtro, spari l'acqua verso l'alto, con la co2 avrai bisogno di movimentare soprattutto a mezza altezza, ma tanto le vedrai nel loro percorso e ti saprai regolare.

Per la radice, propongo di legarci sopra anche un po' di muschio, farà un bell'effetto senza essere troppo impegnativo. Il fondo non piace neanche a me, al posto tuo lo coprirei il più possibile con le piante: un paio di crypto basse (la parva ad esempio), magari un tentativo con il tenellus per riempire davanti...