Se cambio il fondo non perdo la flora batterica contenuta in esso, provocando un innalzamento dei nitriti??

Fondo o filtro?
Nel primo caso, c'è il filtro che mantiene tutto, quindi anche se perdi i batteri del fondo non ci sono problemi.
Nel secondo caso invece si fa un periodo in cui entrambi i filtri sono in funzione, dopo circa 1 mese o qualcosa in più, si elimina il vecchio e si lascia solo il nuovo